實驗室洗瓶機依據循環噴淋原理，利用清洗水沖刷的物理作用和清洗劑乳化、剝離的化學作用對器皿進行清洗，其對水溶性及油脂類污染源器皿清洗有顯著效果，一部分污染源的實驗待清洗器皿利用清洗水沖刷及清洗劑對其乳化、剝離無作用，這就需要對這部分實驗待清洗器皿進行預處理(根據污染源的不同可以選擇進行堿性預泡、有機溶劑預泡、洗液預泡等)，處理后就能達到很好的清洗效果。
而人工洗滌收到工人主觀因素影響大，質量難以做到均以穩定;不具有可記錄、可追溯，且可驗證性差;一些場合下，如器皿規格大，清洗物品數量多的情況下，手工清洗勞動強度大，給質量控制帶來不穩定因素。所以，相較于人工洗滌，實驗室洗瓶機清潔功能更加強大，也更加穩定。
